La quantité de données accumulées chaque jour dans les Centres hospitaliers recèle des informations essentielles pour accroître notre connaissance du cancer : efficacité des médicaments en vie réelle, fréquence des effets indésirables, résistance de certains patients aux traitements, etc. Les technologies du big data offrent aujourd’hui l’opportunité d’exploiter ces données pour faire avancer la recherche et améliorer les soins en cancérologie.
Mais le défi est de taille. Pour le relever, Unicancer construit Consore, un moteur de recherche puissant, capable de retrouver des informations disséminées dans le texte de centaines de milliers de dossiers des patients des Centres de lutte contre le cancer.
La réutilisation des données de soins pour mieux comprendre la maladie cancéreuse est une des priorités d’Unicancer. Cette approche doit devenir un complément incontournable à la recherche en laboratoire.
L’analyse de grandes cohortes de patients nécessite une approche multicentrique est particulièrement utile en cancérologie car elle permet d’étudier un nombre de patients suffisant pour segmenter les cancers en de nombreux sous-types et s’engager plus encore dans une médecine personnalisée aux patients. Aucun centre, même les plus grands, ne peuvent seuls disposer d’un nombre de cas suffisants pour cette recherche. Cette possibilité est offerte par le consortium des Centres qui utilisent Consore.
La quantité de données en santé est massive. Les analyser est complexe, du fait de leur volume et de leur fragmentation dans de nombreuses bases et sources de données cloisonnées (dossiers patient, dossier pharmaceutique, PMSI). La plupart (plus de 80 %) de ces informations sont conservées sous forme de texte ce qui complexifie d’autant plus leur exploitation. Autre difficulté, les informations structurées ne sont pas codées de la même façon d’un établissement à un autre.
Consore se veut utile aux chercheurs comme aux cliniciens. Il offre de multiples possibilités qui vont aller s’amplifier dans les années à venir. On peut citer par exemples :
